科研绘图系列：R语言组合热图和散点图

介绍

热图展示参与者的属性，散点图表示样本的时间跨度。

加载R包

library(tidyverse)
library(ComplexHeatmap)
library(circlize)
library(cowplot)

导入数据

数据可从以下链接下载（画图所需要的所有数据）：

• 百度云盘链接: https://pan.baidu.com/s/1iEE9seTLdrrC3WDHJytvIQ

• 提取码: yvf5

load("figure1ab.RData")

数据预处理

tumortype_order <- tmn_meta_data$dx1_tumortype %>% 
  table %>% sort %>% names
patient_order <- with(tmn_meta_data, setNames(dx1_tumortype, upn)) %>% 
  .[order(match(., tumortype_order))] %>% names

tmn_meta_data_processed <- tmn_meta_data %>%
  mutate(upn = factor(upn, l