在之前的文章中,分享了R语言分组散点图的绘制模板:
特征渲染的散点图的绘制方法:
进一步,再来分享一下滑珠散点图的绘制方法。
先来看一下成品效果:
特别提示:本期内容『数据+代码』已上传资源群中,加群的朋友请自行下载。有需要的朋友可以在同名公号阿昆的科研日常后台回复关键词【全家桶】查看加群方式。
1. 数据准备
此部分主要是读取原始数据,并进行绘图前的预处理。
# 加载库
library(readxl)
library(tidyr)
library(ggplot2)
# 修改工作路径
# setwd("D:/R")
# 读取数据
data <- read_excel("data_bubblescatter.xlsx")
# 将数据转换为数据框格式
data <- as.data.frame(data)
# 排序
data_sorted <- data[order(data$value), ]
data_sorted$name <- factor(data_sorted$name, levels = data_sorted$name)
2. 颜色定义
作图不配色就好比做菜不放盐,总让人感觉少些味道。
但颜色搭配比较考验个人审美,需要多加尝试。
这里直接使用TheBestColors配色工具中的SCI顶刊配色:
library(TheBestColors)
map <- Best100(61)
CC <- map[c(8)]
3.滑珠散点图绘制
利用‘geom_point’函数,绘制初始滑珠散点图。
p <- ggplot(data_sorted, aes(x = value, y = name)) +
geom_point(color=CC,size=4)+
labs(x = 'MeanDecreaseAccuracy', y = 'Product')
print(p)
4. 细节优化
为了插图的美观,对坐标轴细节等进行美化,并按期刊所需分辨率、格式输出图片。
# 细节调整
p +
theme_classic(base_size = 8) + # 设置基本字号为8pt
theme(
panel.border = element_rect(size=0.5,fill = 'transparent'), # 添加全框线
axis.line = element_blank(), # 删除原始轴线
panel.grid.major.y = element_line(size = 0.2, linetype = 'solid', color = "gray"), # 开启y轴主网格线
axis.ticks = element_line(size = 0.5), #设置刻度线粗细与颜色
axis.ticks.length = unit(1.5, "mm"), # 设置刻度线的长度
legend.title = element_blank(), # 设置图例标题为空
legend.position = 'top', # 设置图例位置
axis.text = element_text(size = 10), # 设置坐标轴标签字号和颜色
legend.text = element_text(size = 10), # 设置图例文本字号
axis.title = element_text(size = 10), # 设置坐标轴标题字号
)
# 图片导出
ggsave("滑珠散点图.png", width = 18, height = 18, units = "cm", dpi = 600)
以上。
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